Der Carrier legt den Fokus – wie soll es auch anders sein – besonders auf Deutschland.
Im Winterflugplan könne man sich auf Direkt-Verbindungen von Berlin, Düsseldorf, Frankfurt, Hamburg, München und Stuttgart nach Athen freuen, wie es in einer Aussendung heißt. Passagiere aus Düsseldorf, Frankfurt, München und Stuttgart können zudem während des gesamten Winterflugplans direkt nach Thessaloniki fliegen. Heraklion wird weiterhin von Düsseldorf und Stuttgart (bis zum 31. Oktober), Frankfurt (bis zum 27. November) sowie München (bis zum 28. November) angeflogen. Non-Stop-Flüge von Frankfurt (bis 31. Oktober) und München (bis 30. Oktober) nach Rhodos bietet die Fluggesellschaft ebenfalls an.
Von den Drehkreuzen Athen und Thessaloniki aus bietet Aegean Airlines zahlreiche Anschlussverbindungen zu Zielen in Griechenland wie Heraklion, Chania, Korfu, Kos, Mykonos, Naxos, Santorin und Zakynthos. Bei Reisen nach Griechenland ist im Zuge der Coronavirus-Krise eine Online-Registrierung erforderlich. Urlauber müssen das Online-Formular “Passenger Locator Form” (PLF) spätestens am Tag vor dem Abflug ausfüllen.